五万元是分开存还是一起存，需要结合储户急不急用钱来考虑，如果储户不急用钱，则一起存较好，一般来说，存银行的定期，或者大额存款，其金额越大，利率越高，给储户带来的收益越高，反之，如果储户急用钱，则可以选择分开存，留一部分资金来应急，其中可以采取以下方法来存：
1、四分储蓄法存
把要存的资金分成四份，比例分别是1:2:3:4，比如，把5万分为5000千、1万、1.5万、2万这四等分，这样对于不确定何时用、一次用多少，但有流动性需求的储户来说是较合适的储存方法，即在储存期限内，如果储户想要提前支取，可按自身需求，取出部分即可，不需要全部转为活期，减少了一大部分损失。
2、阶梯储蓄法
把现在的资金，按照金额大小分成若干等份，然后由低到高依次购买银行不同期限的定期存款，比如，储户有5万元，分成三份：1万、2万、和2万，同时，分别存成一年、两年、三年的定期存款。当一年的存款到期，转存成三年。两年到期，一样转成三年。这样两年以后5万元三份的资金就都是三年的定期存款。
3、十二存单法
每月将一笔存款以定期一年的方式存入银行中，坚持整整十二个月，从次年第一个月开始每个月都会获得不菲定期收入的一种储蓄、投资策略。
4、交替存储法
交替储蓄法是指将存款本金一分为二，分别存为两笔半年期和一年期的定期存款，待半年期定期存款到期后，将本息一同转存为一年期定期存款，并与此前存入的一年期的定期存款一起设为自动转存。
交替储蓄法的优势在于，获得一年期定期存款利率的同时，获得半年期的资金流动性。