同业存单有风险，但风险较低。应该说，所有的金融产品都存在风险，只是风险大小不一，同业存单也不例外。
同业存单是由存款类金融机构（主要指银行）在全国银行间市场上发行的一种记账式定期存款凭证。同业存单也属于一种货币市场工具，具有可质押、可转让的特点。
银行发行同业存单一般是出于补充资金缺口、满足流动性需求的目的，也说同业存单是银行进行主动负债管理的工具。另外，由于同业存单是一类标准化的合约，所以它能较好的提高银行筹资的效率。
在发行时，发行方会根据自身资产负债管理的要求和市场供求变化来定价，并决定发行金额与期限。一般来说，同业存单作为货币市场工具，其发行期限通常不会超过一年，常分为一个月、三个月、六个月、九个月和一年期这几类期限，此外，同业存单还具有滚动发行的特点。
以国内发行的同业存单来看，由于发行方多为大中型银行，其信誉良好，预期资金充足，投资者投资同业存单后的收益有着较好的保障，所以风险会相对较低。
同业存单发行后，其可以进入二级市场流通，也可作为质押品进行质押式回购交易，不过同业存单的直接交易对象限制为银行业或非银行业金融机构，个人投资者不在这个范围内。
但是，个人投资者仍可以通过包含有同业存单的理财产品来进行间接投资。一般以同业存单作为投资标的的产品风险往往也很低，并且流动性也不差，很适合满足一部分投资者对于短期内寻求稳健投资的需求，或是作为投资者自行拟定投资组合的补充。