套期保值是国债期货最基本、最重要的市场功能之一。在期货套期保值操作中，投资者会根据现货头寸反向建立期货头寸，其目的是使得期货和现货的组合头寸风险尽量呈现中性。如此操作的原因主要在于，期货和标的现货价格之间会存在较强的相关关系。国债期货是如何套期保值呢？
国债期货套期保值的原理：
1．期货与标的现货价格走势基本一致。
虽然现货市场与期货市场是两个各自独立的市场，但由于期货价格最主要的影响因素就是标的现货的价格，因而一般情况下两个市场的价格变动趋势是基本一致的。如果期货与标的现货价格的走势出现偏离，有无风险套利机会存在，则市场套利者会进行操作，最终使得期货与标的现货价格回复到无套利的市场均衡价格上。
2．随着期货合约到期日的临近，现货市场与期货市场价格趋向一致。
期货合约的交割制度，保证了标的现货与期货价格随期货合约到期日的临近而趋于收敛。如果在交割日，期货价格与现货价格不同，例如期货价格高于现货价格，那么套利交易者就会卖出高价的期货合约，同时买入低价的现货，在无风险的情况下交割获利。这种套利交易最终使国债期货价格和现货价格趋向一致。
投资者建立了与现货市场相反的期货头寸，无论市场价格朝哪一方向变动，构建的现货与期货组合均可避免风险，实现保值。