虹吸式马桶工作原理是依据虹吸现象，利用冲洗水在坐便器里的污水管道内充满水后构成的，能快速的将污物排走。在虹吸式马桶内部有一套完整的管路，呈现出形状是侧倒状S形，构成了倾斜度较缓的池壁，在冲水时噪声特别小，基本上达到静音效果。虹吸式马桶的冲力比较强，能轻易将黏附在坐便器池壁里的脏污冲走并快速排出去。在虹吸式马桶的池壁中存水的面积比较大，因此防臭的效果比直冲式的马桶好。
虹吸式马桶优缺点：(一)优势：其产品外观设计美观，造型感强，看起来档次也比较高；它在使用时噪音比较小，唯有有时冲完会听见气体重返管道中的一点响声，能够避免使用者尴尬情况；虹吸式马桶便于清理，它能够轻松冲走粘附在坐便器表层的污物。
(二)缺点。它的体积比较大，也比较占空间，因此业主们在安装前需要给它预留好足够空间；因为虹吸式马桶排污管道的S弯弯度比较大，其管道直径较窄，仅是直排式的1/3，因此与直排式坐便器相比较，他会容易出现被堵现象；虹吸的抽水力大，对水量的要求也就比较大，相对来说虹吸式马桶比较费水。